Ústav makromolekulární chemie AV ČR
banner

Detail tématu

Téma Strojové učení a pokročilá NMR krystalografie - komplementární nástroje pro optimalizaci cest určování a predikce struktur krystalických peptidů a jejich amorfních analogů
Školitel Ing. Jiří Brus, PhD, DSc
Konzultant Mgr. Jiri Czernek, PhD
Oddělení NMR spektroskopie
Anotace Farmaceutický výzkum se trvale zaměřuje na hledání nových materiálů a léčiv na bázi peptidů či oligopeptidů. Znalost struktury těchto systémů je nezbytná pro optimalizaci jejich fyzikálně-chemických vlastností a skutečnou terapeutickou aplikaci, avšak určení struktury těchto pevných látek, které většinou existují v mikrokrystalickém, semikrystalickém a amorfním stavu, je obtížné, ne-li zcela nemožné. Novou možnost v této oblasti nyní přinášejí pokročilé metody NMR krystalografie a predikce struktury využívající kvantově-mechanické přístupy, strojové učení a rozsáhlé předpovědi NMR parametrů. Všechny tyto metody lze považovat za komplementární, kdy popisují strukturu v pevném stavu nezávisle na sobě. Nicméně každá z nich má svá specifická omezení. Cílem tohoto doktorského projektu je vyvinout a otestovat metodiku řešení komplexních struktur peptidů a oligopeptidů v jejich krystalickém a amorfním stavu založenou na kombinaci experimentální ss-NMR spektroskopie a rozsáhlých předpovědí struktur.
Vysoké školy